在生命科学研究与生物医药开发中，蛋白质的结构与功能密切相关，而蛋白的全长序列信息则是解析其功能、突变位点修饰及翻译后加工等过程的关键数据基础。传统质谱方法往往依赖酶解将蛋白“打碎”成肽段进行识别，可能导致序列信息缺失。蛋白全长测序（Full-Length Protein Sequencing, FLPS）通过多酶组合和高精度质谱平台，致力于获取蛋白质的完整序列信息，已成为蛋白质组学研究中逐步兴起的补充技术路线。

1、什么是蛋白全长测序？为何它如此重要？

蛋白全长测序旨在解析蛋白分子的完整氨基酸序列，涵盖N端、C端及中间区域，避免了传统酶解方法可能遗漏的结构域或修饰位点。这项技术在以下研究场景中展现出不可替代的价值：

（1）抗体序列解析与专利申报：精确获取轻链与重链全序列，支持抗体人源化设计与知识产权保护

（2）生物药质量控制：识别突变、异构体、剪切变体等产品一致性问题

（3）新蛋白功能研究：探索天然蛋白的新型翻译变体、修饰模式和信号肽保留区段

2、技术挑战：全长测序为何难以实现？

与基因组测序相比，蛋白质全长测序面临三大难点：

（1）肽段覆盖不足：传统酶切法依赖酶解模式，难以全面覆盖蛋白全长

（2）翻译后修饰复杂：如磷酸化、糖基化等修饰影响碎片离子特征，干扰序列解析

（3）分子异构体共存：同分异构体（如异构肽）造成数据库搜索歧义，增加序列不确定性

3、高精度蛋白全长测序策略：多酶组合与串联质谱平台

为了应对上述挑战，百泰派克生物科技采用了一套集多酶切割策略、多级质谱采集（MSn）与de novo解析算法于一体的高覆盖度测序流程：

（1）多酶切割+多模式建库

我们综合使用Trypsin、Chymotrypsin、Glu-C等多种酶切方式，最大程度打破结构域限制，提高覆盖度。同时支持非酶解策略（top-down或middle-down），用于保留蛋白天然修饰状态。

（2）高分辨串联质谱平台

采用Orbitrap Eclipse、timsTOF等高分辨质谱设备，结合HCD+ETD双碎裂模式，有效识别PTMs（翻译后修饰）并提高低丰度肽段检测灵敏度。

（3）de novo+database双模式解析

结合数据库检索与de novo算法交叉验证，提升新型突变或未知蛋白序列的准确性与完整性。

（4）低样本起始量，适配多种样品类型

百泰派克生物科技的全长蛋白测序服务支持从低至1µg蛋白样本起始，适配血清、细胞裂解液、纯化蛋白、组织匀浆等多种样品来源。特别适合临床样本和珍稀样本的研究需求。

4、总结：从蛋白肽段走向完整序列

蛋白全长测序技术正逐步从探索性研究走向高通量与高重现性的标准化应用。它不仅拓展了蛋白质组学的边界，更为抗体药物开发、生物制剂质控、以及基础生命科学研究提供了全新的数据维度。在百泰派克生物科技，我们专注于提供高质量、可交付全长序列的定制化测序服务，助力科研人员深入解析蛋白功能的每一个氨基酸位点。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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